养殖企业在运营过程中需要缴纳以下税费：增值税养殖企业销售自产农产品免征增值税。其他销售行为若产生应税产品，需按实际销售金额缴纳增值税。企业所得税养殖企业从事农林牧渔业项目的所得可以免征或减征企业所得税。具体免税项目包括牲畜、家禽的饲养。企业所得税法规定，企业从事农、林、牧、渔业项目的所得，可以免征、
